Prosedyre for innsamling av forskningsprøver i Den norske Downs syndrom- og demensstudien
Dato: 12.03.2020 Versjon: 1.1
Utarbeidet av: Ingrid Tøndel Medbøen, 95228986, ingrid.medboen@aldringoghelse.no Ta kontakt ved spørsmål.
Ansvarhavende for biobanken: Geir Selbæk, geir.selbæk@aldringoghelse.no, tlf 95883535 Prosjektleder: Ellen Melbye Langballe, eml@aldringoghelse.no, tlf 90202058
Prosjektmedarbeider: Frode K. Larsen, frode.larsen@aldringoghelse.no, tlf 99354810
Hensikt, innhold og omfang
Hensikten er å innføre en felles, standardisert prosedyre for innsamling av forskningsprøver.
Hvis pasienten samtykker til å avgi forskningsprøver i forbindelse med deltakelse i den norske Downs syndrom- og demensstudien, lagres serum, plasma og fullblod i
forskningsbiobanken.
Rekruttering av deltakere vil foregå i perioden 2020-2023. Omfanget vil variere fra enhet til enhet, men trolig være mellom 5-15 pasienter. Samme prøvesett tas ved to tidspunkt med omtrent 12 måneders mellomrom. Habiliteringsenheten har ansvar for å innhente skriftlig samtykke og kontakte laboratoritet for avtale om tidspunkt for prøvetaking. Normalt vil det rekvireres rutineprøver i forbindelse med at deltaker er til vurdering ved
habiliteringstjenesten, og forskningsprøvene tas da samtidig med rutineprøvene.
Navn på laboratorium og kontaktperson
Navn på habiliteringsenhet og kontaktperson
Prosjektmedarbeider den norske Downs syndrom- og demensstudien
Ingrid Tøndel Medbøen
95228986,
ingrid.medboen@aldringoghelse.no
Anskaffelse av rør og annet utstyr
For oversikt over utstyr, se vedlegg 1. Det vil sendes ut utstyr før oppstart. Rør/utstyr som trengs for hver visitt vil pakkes og sendes som ferdige «kit» dersom det er ønskelig. Det forutsettes at de aktuelle laboratoriene har annet nødvendig utstyr som sentrifuge, pipetter og fryser som holder -80°C. Rør og korker bør lagres i lukket miljø (boks/pose/skap) for å unngå forurensning før bruk. Lagres i romtemperatur. Ved behov for mer utstyr underveis sendes bestilling til Ingrid T. Medbøen.
Loggføring
Husk å føre oversikt over dato og tidspunkt for prøvetaking og frysing, samt eventuelle avvik fra prosedyren eller andre merknader. Se forslag til mal (Vedlegg 2).
Prosedyre forskningsbiobank den norske Downs syndrom- og demensstudien Versjon 1.1 – 12.03.2020
Merk samtlige rør
Det skal ikke være opplysninger om navn eller personnummer på forskningsprøvene.
Prøvene merkes med ferdig trykte etiketter med studienummer som sendes ut før oppstart.
Studienummeret må opplyses av habiliteringsenheten slik at riktig prøve kan kobles til riktig deltaker. Siden det vil være deltakere som ikke samtykker til å avgi forskningsprøver, vil det være noen av de ferdig trykte etikettene med studienummer som ikke tas i bruk og kastes.
Studienummeret er bygd opp slik:
H = Habiliteringstjeneste/Steds-ID (hver enhet får på forhånd tildelt et nummer) D = Deltakernummer
T = Testrunde/prøvetaking (T1/T2)
Eks: ved enhet nummer 1, vil første deltaker på første runde med undersøkelser og
prøvetaking ha studienummer: H01D01T1. Ved andre runde etter 6-12 måneder: H01D01T2.
Hvis ferdig trykte etiketter mangler, eller ved tvil om hvilken testrunde prøvetakingen er del av, kan steds-ID, deltakernummer (for eksempel H01D01) og dato for prøvetaking skrives på tomme etiketter med frysesikker tusj.
Bearbeiding og fordeling av serum, plasma og EDTA-fullblod:
NB: Primærrørene (vakuumrør) fylles i rekkefølgen: Serum → EDTA
Bruk butterfly kanyle grønn 21G → for å fjerne luft i slangen før første rør fylles må det brukes et kasteglass. Det er lagt ved et ekstra serumgelrør til dette formålet.
Fyll 2 x Serumgelrør og 3 x EDTA-rør. Vend rørene forsiktig 5-10 ganger, umiddelbart etter prøvetaking.
A) 2 x Serumgelrør (rød kork med gul ring)
Minst 30 min henstand i romtemperatur før sentrifugering (må stå oppreist).
Sentrifugeres innen 60 min, 2200 x g i 10 minutter i romtemperatur (ca. 20°C) Serum fordeles i kryorør, 0,6 ml per rør, bruk rød kork.
Noter «rest» på etikett hvis ikke nok til 0,6 ml i siste rør.
B) 3 x EDTA-rør (lilla kork med svart ring)
1) To av EDTA-rørene sentrifugeres etter 10 minutter (og innen 30 minutter), 2200 x g i 10 minutter i romtemperatur (ca. 20°C)
Plasma fordeles i kryorør, 0,6 ml per rør, bruk lilla kork.
Noter «rest» på etikett hvis ikke nok til 0,6 ml i siste rør.
2) Det tredje EDTA-røret skal ikke sentrifugeres, men lagres som fullblod.
Fullblod fordeles i kryorør, 0,6 ml per rør, bruk grønn kork.
OBS! Lange pipettespisser kan være en fordel ved fordelingen.
Noter «rest» på etikett hvis ikke nok til 0,6 ml i siste rør.
Frysing/oppbevaring:
Etter bearbeiding og fordeling settes prøvene så fort som mulig i fryser ved -80°C i merkede bokser. Prøvene bør fryses innen 2 timer fra prøvetaking.
Oppbevaringsbokser med prøver merkes med: Den norske Downs syndrom- og demensstudien samt navn på habilteringsenhet/ laboratorium/ sykehus.
Holde oversikt og registrere avvik
Følgende skal registreres for hver prøvetaking:
• Studienummer
• Omtrentlig tid siden siste måltid
• Prøvetype (serum/plasma/fullblod osv)
• Dato for prøvetaking
• Tidspunkt for prøvetaking
• Tidspunkt lagt i fryser -80°C
• Avvik fra prosedyre/merknad
Registreres ved laboratoriet. Vedlagt mal (se vedlegg 2) kan benyttes.
Når prøver sendes til Ullevål for langtidslagring kan skjema legges med i forsendelsen.
Oversiktslista skal ikke inneholde navn og personnummer.
Langtidslagring i biobank i Oslo
Materialet lagres lokalt for så å transporteres til Oslo. I utgangspunktet kan forsendelse til Oslo avvente til innsamlingsperioden er avsluttet, men det kan også blir aktuelt å sende det underveis i prosjektperioden, for eksempel hvis laboratoret har begrenset lagringsplass eller det er ønskelig å gjøre analyser på noe av materialet.
Ved spørsmål eller avtale om forsendelse til Oslo, kontakt Ingrid T. Medbøen, 95228986, ingrid.medboen@aldringoghelse.no
Kostnader
Studien kan dekke kostpris for prøvetaking og prøvehåndtering etter avtale, som må avklares med prosjektleder Ellen Melbye Langballe i forkant av oppstart.
Studien dekker fraktkostnader ved transport til Oslo.
Fakturaadresse:
Sykehuset i Vestfold HF
Regnskapskontoret, Postboks 2168, 3103 Tønsberg,
Org.nr: 983 975 259
Faktura må merkes med: Prosjektnummer: 186002, Kostnadssted: 496001
Prosedyre forskningsbiobank den norske Downs syndrom- og demensstudien Versjon 1.1 – 12.03.2020
Vedlegg 1: Utstyr
Tabell 1. Rør ved blodprøvetaking.
Hva Bilde Bruksområde Varenavn # per
pasient
Leverandør og varenr.
Serumrør
Rød kork m/gul ring
Fremstilling av serum og kasteglass
VACUETTE®5 ml Serum Gel u/skru
3
Med Kjemi (Greiner Bio-One) G456073
EDTA-rør
Lilla kork m/svart ring
Fremstilling av plasma og fullblod til DNA-isolering
VACUETTE® 6 ml EDTA-K2 u/skru
3
Med Kjemi (Greiner Bio-One) G456043
Kryorør uten kork
Serum og plasma
Micro tube 1.5
ml, PP 21-30 Sarstedt
72.703
Rød skrukork Serum Screw cap, PP,
red 7-10 Sarstedt
65.716.003
Lilla skrukork Plasma Screw cap, PP,
violet 7-10 Sarstedt
65.716.008
Grønn skrukork Fullblod Screw cap, PP,
green 7-10 Sarstedt
65.716.005
Tabell 2. Annet nødvendig utstyr.
Hva Bruksområde Varenavn Leverandør og
varenr.
Etiketter Merking av rør (for hånd) Cryo-Pro Labels VWR 817-5001 Tusj, frysesikker
(svart,rød,blå og grønn) Merking av rør og bokser Penn for fryse-merking, Nunc
VWR 811-0009 Pipettespisser Fordeling av serum og
plasma
Pipet tips 100-1000µl, 6 racks med 96 i hvert.
VWR 613-0341 Pipettespisser lange Fordeling av fullblod
UltraFine, FlexTop, ekstra lang 100 - 1250 µl, 6 racks med 96 i hvert.
VWR 613-0273 Oppbevaringsboks med
inndeling Serum, plasma, fullblod Storage Box f. 81 Micro tubes
Sarstedt 95.064.981 Butterfly grønn 21G Blodprøvetaking VACUETTE sikkerhetsVPS
21G, 19 cm
Med Kjemi G450081
Vedlegg 2. Mal for oversikt forskningsprøver ved laboratoriet
Fyll ut et skjema for hver deltaker:
Studienummer:_________________________
Omtrentlig tid siden siste måltid?_______________________
Skjemaet/kopi legges med prøvene ved forsendelse til Ullevål for langtidslagring.
Ved spørsmål, eller avtale om forsendelse kontakt Ingrid T. Medbøen, 95228986, ingrid.medboen@aldringoghelse.no Prøvetype Antall Dato
prøvetaking
Klokkeslett prøvetaking
Klokkeslett lagt i
fryser -80°C Avvik fra prosedyre/merknad/signatur Serum
Plasma
Fullblod
