Bioforsk Rapport
Vol. 2 Nr. 74 2007
Populasjonsovervåkning av brunbjørn (Ursus Arctos) 2005-2008
DNA-test for rødrev (Vulpes vulpes) utført på brunbjørn-negative ekskrementprøver fra 2006
Siv Grete Bjervamoen og Hans Geir Eiken Bioforsk Jord og Miljø Svanhovd
Bjerva
Forsid
amoen, S.G. og
debilde: Stei
Eiken, H.G. Bio
inar Wikan
oforsk Rapport vol. 2 (74) 20077 2
Bjerva
Inn
1.
2.
3.
4.
5.
6.
amoen, S.G. og
nhold
Sammendra Innledning . Metoder ....
Resultater o Referanser Vedlegg 1 ..
Eiken, H.G. Bio
g ...
...
...
og konklusjon ...
...
oforsk Rapport
...
...
...
n...
...
...
vol. 2 (74) 2007
...
...
...
...
...
...
7
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
... 4
... 5
... 6
... 7
... 8
... 10
3
4 5 6 7 8 0
Bjerva
1.
Popusaml DNA DNA fungsom for b trek
amoen, S.G. og
Sam
ulasjonsove let inn 662
profil for -test for r gerende ek
utgjør 17 bjørn tota
ker bort di
Eiken, H.G. Bio
mend
ervåkning 2 ekskrem bjørn på rødrev (Vu
kskrementp % av tota alt i 2006- isse 113 rø
oforsk Rapport
drag
av brunbj entprøver 227 av dis lpes vulpe prøvene fr lt mottatt innsamling ødrevekskr
vol. 2 (74) 2007
ørn (Ursus i Norges f sse prøven es), og der ra 2006. A te ekskrem
gen vil de rementene
7
s arctos) i fem nordli ne. Denne retter anal Av disse 4 mentprøver rmed gå o e i materia
2006 resu igste fylke rapporten lysen av de 435 prøven
r i 2006. A opp fra 34
let.
ulterte i at er. DNA an beskriver e resteren ne var 113 Andelen prø
4 % til 41
t det ble d nalyse gav
r en spesif nde 435 ikk
rødrev, n øver positi
% dersom
4
det en ke-ikk noe ive vi
Bjerva
2.
I 200 fem (Eike ulike 2006 posit andr av Natu pros rødr eksk eksk (Eike
Figur popu
amoen, S.G. og
Innle
06 ble det nordligste en et al. 2 e fylkene ( 6 viser at
tive ekskre re arter (rø bjørn er urforvaltni
jektet, ut rev (Vulpe krementprø krementprø en et al. 2
r 1. Rødrevek lasjonsoverv
Eiken, H.G. Bio
ednin
samlet inn e fylker. Av 2007). I in (10-50 %), med bruk ementprøv ødrev, gre en mul ng ble det fra mulig es vulpes)
øver, tota øver, og a
007).
kskrement (v våkning på br
oforsk Rapport
ng
n 662 eksk v disse gav nsamlinge og også st av samme ver lavere evling, elg lig feilkil t konklude heter for ble etab alt 435 andre prøv
venstre) og b runbjørn.
vol. 2 (74) 2007
krementprø v 227 prøve n var der tor variasjo e metode
enn tidlig med mer) lde. Etter
rt med at forveksling blert, og
prøver. D ver (hår m
bjørneekskre
7
øver til DN er en fullst
stor varias on mellom
som i 2005 gere. Innsa i innsaml r en dis rødrev va g i felt (fig
deretter Denne till med mer)
ement (høyre
NA-analyse tendig DNA sjon i and enkelte re 5 (Eiken e amling av ingen til p skusjon m
r prioritert gur 1). En utført på leggsrappo er beskrev
e) kan forvek
for brunbj A profil på
el positive egioner. R et al. 2006 ekskreme populasjon med Direk
t i en utvi spesifikk alle ikke orten omh vet i tidlig
ksles i innsam
jørn i Norg å bjørn (34 e prøver i Rapporten f 6) er andel entprøver
sovervåkni ktoratet f
det analys DNA-test f e-fungeren
handler k gere rappo
mling til
5
ges %) de len for fra ing for se i for nde kun ort
Bjerva
3.
Den fragm forw bindpåfø et a ca 9
Figur kapil viser
amoen, S.G. og
Meto
spesifikke menter fra ward prime
der seg til d ølgende an
l. 2007). E 8 basepar
r 2. DNA-test lærelektrofo en negativ k
Eiken, H.G. Bio
oder
e DNA-test a kontrollr er som er a de fleste p nalyse i ka Ekskremen
(figur 2). T
t for rødrev ( orese (ABI 31 kontroll med
oforsk Rapport
ten som b regionen i arts-spesifi pattedyr (p apillærelek
tprøver so Testen ble
(vulpes vulpe 10) for rødre d DNA fra bru
vol. 2 (74) 2007
ble brukt b mitokondr kk for rød pers. med ktroforese om var pos e utført me
es). Panel 1 v-DNA fra he unbjørn (Urs
7
baserer se rie DNA, og
rev (VUL1F Ø. Flagsta ble utført sitive for r ed positive
(øverst) og 2 enholdsvis ve us arctos).
eg på PCR- g følgende F) og en re ad, Dalèn e
t som tidli rødrev had e og negati
2 (midten)vi ev og ekskre
-amplifiser e primere b
evers prime et al., 200 igere besk dde DNA-fr
ive kontro
ser resultate menter. Pan
ring av DN ble brukt:
er (H3R) so 04). PCR m krevet (Eik ragmenter
ller.
et fra nel 3 (neders
6
NA- en om med ken på
st)
Bjerva
4.
Av d utsla 2006 ekski Rov
De 1 finne som bjør rødr innsa i Fin Ande
% de og N tidlig prøv Til innsa eksk En asann fung
amoen, S.G. og
Resu
de 435 ikk ag for rødr 6 (662 prø krementprø vbase 3.0.
113 positiv es flere pr lar seg PC n og ande rev viser li amlingen i nnmark var elen prøve ersom vi ta Nord-Trønd gere studi ver fortsatt slutt kan amlingen krementer annen muli ntids-PCR) gerende pr
Eiken, H.G. Bio
ultate
ke-fungere rev (vedleg øver). Ta
øver for hv
ve prøvene røver fra r CR-amplifis eler funger ikevel at i de fleste r forvekslin er positive ar bort de delag nær ier, mens t lav.
vi slå fa som vir fra andre
ighet er å for å på
øver.
oforsk Rapport
er og k
ende ekskr gg1). Dett abell 1 vis
vert enkelt
e er et mi rødrev i m sere. Det g rende prøv
forveksling regionene ng med rød for bjørn 113 rødre rmer ande for Nord
ast at for kelig er arter, og bruke me åvise DNA
vol. 2 (74) 2007
konklu
rementprøv e utgjør 1 ser en ove
t fylke. Re
inimumsta materiale, u
gjelder sel ver (tabel g med bjø e/fylkene ( drev ikke e totalt i 20 evekskreme elen bjørn dland og s
rtsatt er fra bjør i så fall m er sensitive A fra brun
7
usjon
vene som 7 % av tot ersikt ove esultatet f
ll, siden d uten at di
vsagt det s ll 1). De 1 ørneekskre (17-25 % rø et problem
006-innsam entene i m e-DNA pos særlig Sør
det ukjen rn. Mater må spesifik e DNA-me nbjørn (el
ble analy alt mottat r antall o ra alle enk
det er rime sse har git samme ogs 113 prøven ementer va ødrevekskr m i 2006 inn mlingen vil materialet.
sitive prøv r-Trøndelag
nt hvor m rialet kan kke DNA-te toder i fre ller andre
ysert, gav tte ekskrem og prosent
keltprøven
elig å anta tt DNA i e så for DNA ne som er
ar et prob rementer) nsamlingen l gå opp fr
For Finnm ver seg re g er ande
mange prø n fortsatt ester gi sv emtiden (f e arters D
113 posit mentprøve t fungeren ne er lagt i
a at det k ekstraksjon A-analysen r positive f blem i 200 . I Anarjok n.
ra 34 % til mark, Trom
esultatet elen positi
øver i 200 t innehol var på dett
for eksemp DNA) i ikk
7
tivt er i nde inn
kan nen av for 06- kka
41 ms, fra ive
06- lde
te.
pel ke-
Tabell 1: Fylkesvis fordeling av totalt antall innleverte ekskrementprøver, samt antall fungerende ekskrementprøver hvor det er påvist DNA fra brunbjørn (Ursus arctos) eller rødrev (Vulpes vulpes).
Fylke / Region Total antall innsamlede ekskrementprøver 2006
Totalt antall fungerende ekskrementprøver for
brunbjørn
Totalt antall fungerende ekskrementprøver for
rødrev
Totalt antall innsamlede ekskrementprøver etter
revtest*
Fungerende ekskrementprøver for brunbjørn etter revtest*
n n % n % n %
Finnmark - Øst 173 60 34,7 29 16,8 144 41,7
Finnmark- Anarjokka 39 18 46,2 0 0,0 39 46,2
Troms 32 16 50,0 7 21,9 25 64
Nordland 24 5 20,8 6 25,0 18 27,8
Nord Trøndelag 333 122 36, 6 56 16, 8 277 44,0
Sør Trøndelag 59 6 10,2 15 25,4 44 13,6
Oppland 1 0 0,0 0 0,0 1 0
Sogn og Fjordane 1 0 0,0 0 0,0 1 0
Totalt alle fylker 662 227 34,3 113 17,1 549 41,3
* totalt innsamlede ekskrementprøver minus prøver positivt testet for rødrev
5. Referanser
Dalén L.; Götherström A.; Angerbjörn A. (2004). Identifying species from pieces of faeces. Cons.gen. 5, 109-111(3).
Eiken et al. 2006. Populasjonsovervåkning av brunbjørn 2005-2008: Rapport for Sør- Varanger, Finnmark for 2004 og 2005. Bioforsk rapport 62:1-18
Eiken et al. 2006. Populasjonsovervåkning av brunbjørn 2005-2008: Rapport for Sør- Trøndelag, Nord-Trøndelag, Nordland, Troms og Finnmark. Bioforsk rapport 47:1-29
Bjerva
6.
Eksk
P BF00 BF02 BF02 BF02 BF02 BF06 BF06 BF07 BF07 BF07 BF08 BF08 BF08 BF08 BF08 BF08 BF08 BF08 BF09 BF09 BF10 BF14 BF16 BF18 BF20 BF21 BF22 BF23 BF23 BF24 BF24 BF25 BF28 BF29 BF30 BF30 BF31 BF32 BF32 BF34
amoen, S.G. og
Vedl
krementprø
Prøvenumm 09
24 25 26 27 65 66 71 72 79 80 81 82 83 84 85 86 87 91 95 05 43 65 81 07 17 24 32 33 41 47 53 86 94 01 02 19 20 21 40
Eiken, H.G. Bio
legg 1
øver som g
er R 30 R 30 R 30 R 30 R 30 R 30 R 30 R 30 R 30 R 30
oforsk Rapport
1
gav positivt Rovbase nr
9 567 9 622 9 658 9 674 9 708 9 717 9 727 9 744 9 746 9 761
vol. 2 (74) 2007
t utslag fo
r B 00
7
or rødrev (V Strekkode
008040
Vulpes vulp
Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Nord Nord Nord Nord Nord Sør T Sør T Nord Nord Nord Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Finn Nord
pes).
Fylke/Regio mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag Trøndelag Trøndelag dland dland dland
mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst mark‐øst dland
on
10
Bjerva
BF34 BF34 BF36 BF37 BF37 BF37 BF37 BF38 BF38 BF38 BF38 BF39 BF39 BF39 BF39 BF42 BF42 BF44 BF44 BF44 BF44 BF44 BF45 BF46 BF46 BF46 BF47 BF47 BF47 BF48 BF48 BF48 BF48 BF49 BF49 BF50 BF50 BF50 BF51 BF51 BF51 BF52 BF52 BF52 BF53 BF53 BF53
amoen, S.G. og
45 47 69 70 71 73 76 83 84 86 87 91 95 98 99 25 27 40 41 46 47 48 55 63 64 69 74 77 78 81 84 85 86 95 96 00 04 07 13 15 18 24 25 26 31 32 34
Eiken, H.G. Bio
R 40 R 40 R 40 R 40 R 30 R 40 R 40 R 30 R 40 R 40 R 40 R 40 R 40 R 40 R 40 R 40 R 40 R 40 R 40
oforsk Rapport
0053 0055 0054 0062
6057 0085 0079 2950 0120 0122 0138 0171 0144 0145 0146 0154 0162 0163 0168
vol. 2 (74) 2007
B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00
7
008036 008035
003159 003119 003158 003227 006883
001557 001217 009977 008376 001362 001553 001559 002474 008652 001562 001227 008321 007806 008323 009928 001463 001215 002214 001006 001561 001560
Nord Nord Sør T Sør T Sør T Sør T Sør T Sør T Sør T Sør T Sør T Sør T Sør T Sør T Sør T Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord
dland dland Trøndelag Trøndelag Trøndelag Trøndelag Trøndelag Trøndelag Trøndelag Trøndelag Trøndelag Trøndelag Trøndelag Trøndelag Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag
11
Bjerva
BF53 BF53 BF54 BF54 BF55 BF55 BF56 BF56 BF57 BF57 BF57 BF57 BF57 BF57 BF58 BF59 BF60 BF61 BF61 BF63 BF63 BF64 BF64 BF65 BF65 BF65
amoen, S.G. og
36 39 41 43 52 56 67 68 71 72 73 74 75 79 85 95 04 14 17 36 39 44 49 51 52 53
Eiken, H.G. Bio
R 40 R 30 R 40 R 30
oforsk Rapport
0061 9821 0071 9920
vol. 2 (74) 2007
B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00 B 00
7
001734 001465 008371 001041 008304 008700 007816 008347 001555 008392 001363 008369 008320 001678 001226 006708 001645 001197 006712
008622 008540 003260
Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Nord Trom Trom Trom Trom Trom Trom Trom
d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag d Trøndelag ms
ms ms ms ms ms ms
12
