Lack of Science teachers and teaching facilities

O RNA total foi extraído da amostra infectada usando TRIzol Reagent (Invitrogen) de acordo com as instruções do fabricante. O produto de PCR referente à CP do vírus foi amplificado usando o iniciador oligodT50PacIM4 (5’-TCA GCA CTG ACC CTT TTG AAT TAA T50-3’) por meio de transcrição reversa usando a enzima Superscript III (Invitrogen). O iniciador SapoVLP For (5'- TTT GGA ATT CCA CCA TGG AGG GCA ATG GCT CCC A - 3') foi usado para a PCR em combinação com PacI-M4-SacI Rev (5'- TTT GAG CTC TTT TCC CAG TCA CGA CTT AAT TAA -3'). O fragmento obtido por PCR, usando LongAmp Taq DNA polimerase (New England Biolabs) foi de 2.2 kpb.

4.3.1 Clonagem e Sequenciameto

Após a purificação em gel de agarose 1% utilizando kit “Illustra GFX PCR DNA and Gel Band Purification” (GE Healthcare), o produto de PCR foi ligado ao vetor pGEM-T Easy (Promega) (Figura 15) de acordo com as instruções do fabricante. Em seguida transformado em E. coli eletrocompetente (DH5α). Um volume de 200 µl do transformante foi plaqueado em placa de petri contendo 20 ml de meio LB Agar mais ampicilina (50ng/ml), IPTG (100 ng/ml) e X-gal (20 ng/ml). Após 24h na estufa a 37°C as colônias brancas foram inoculadas em três ml de meio LB líquido contendo ampicilina (50 ng/ml) por 16h em agitação de 240 rpm a 37°C. Foi então feito miniprep desses inóculos a fim de extrair o DNA plasmidial. Para confirmar quais os possíveis clones foi realizada uma digestão dupla com as enzimas EcoRI e SacI (New Englad Biolabs), NEB buffer quatro, BSA (New England Biolabs), de acordo com as instruções do fabricante.

Figura 15. Representação do vetor pGEM-T easy (Invitrogen). O vetor pGEM-T easy apresenta gene de resistência a ampicilina, promotor lacZ e sítios de restrição EcoRI e SacI, utilizados para liberação do inserto referente ao gene da proteína do capsídeo.

Dois clones foram selecionados para sequenciamento e em seguida uma sequência consenso foi gerada usando o software Staden 4.0 (Staden, 1996). Esses clones foram analisados para a confirmação da sequência que posteriormente foi subclonada no vetor pFastBac1 (Invitrogen), para a construção do bacmídeo.

4.3.2 Sistema Bac-to-bac

O gene da CP foi inserido no vetor pFastBac1 (Invitrogen) sob o controle do promotor da poliedrina, considerado forte. Geralmente, os genes inseridos nessa região são expressos na fase tardia da infecção pelo baculovírus recombinante. Assim como, o gene da CP foi duplamente digerido com as enzimas EcoRI e SacI (New England Biolabs) o vetor pFastBac1 (Invitrogen) (Figura 16) foi digerido e defosforilado com CIP (New England Biolabs) por uma hora a 37°C, de acordo com as instruções do fabricante. A ligação do gene da CP no vetor foi realizada utilizando a enzima T4 DNA ligase (New England Biolabs) de acordo com as instruções do fabricante.

Figura 16. Representação do vetor de expressão em células de inseto pFastBac1 (Invitrogen). O vetor pFastBac1 apresenta gene de resistência a gentamicina, promotor da poliedrina e sítios de restrição EcoRI e SacI, utilizados para inserção do inserto referente ao gene da proteína do capsídeo.

Foi realizada a transformação dessa nova clonagem em célula eletrocompetente DH5α (E. coli). Um volume de 200 µl do transformante foi plaqueado em placa de petri contendo 20 ml de meio LB Agar mais canamicina (40ng/ml). Após 24h de incubação na estufa a 37°C as colônias brancas foram inoculadas em 3 ml de meio LB líquido contendo canamicina (40 ng/ml) por 16h em agitação de 240 rpm a 37°C. Foi então feito miniprep desses inóculos a fim de extrair o DNA plasmidial, para posterior sequenciamento e confirmação da correta ligação do gene de interesse no vetor (pFastBac1).

O sistema de expressão de baculovírus Bac-to-bac (Invitrogen) (Figura 17) contém uma linhagem de E. coli DH10Bac que fornece as duas moléculas necessárias para que ocorra a transposição, o bacmídeo bMON14272 (136 kb) e o plasmídeo helper pMON14272 (13,2 kb), que fornece a função de transposição Tn7 in trans (Barry, 1988) ao produzir uma transposase de forma constitutiva. Dessa forma, após a confirmação por sequenciamento de dois clones ligados corretamente em pFastBac1 (Invitrogen) foi realizada a transformação dos plasmídeos purificados em DH10bac, célula termocompetente, de acordo com as instruções do fabricante. Foi plaqueado 200 µl do transformante em uma placa de petri contendo 20 ml de meio LB Agar mais tetraciclina (50ng/ml), canamicina (40ng/ml), gentamicina (sete ng/ml), IPTG (100 ng/ml) e X-gal (20 ng/ml). Após 48h na estufa a 37°C as colônias brancas

foram inoculadas em três ml de meio LB líquido contendo tetraciclina (50 ng/ml), canamicina (40 ng/ml) e gentamicina (sete ng/ml) por 16h em agitação de 240 rpm a 37°C. Foi então feito um miniprep desses inóculos a fim de extrair o DNA plasmidial.

Os bacmídeos recombinantes foram analisados por PCR para confirmar a transposição utilizando-se iniciador específico para CP (Sapo_VLPFor) e também para sequência M13 que flanqueia o sítio de transposição (M13 Rev). Essa amplificação foi realizada como controle da transposição do gene de interesse para genoma do baculovírus. A reação foi feita com LongAmp Taq polimerase, 2,5 nM dNTP, buffer LongAmp um µl de DNA plasmidial, num tempo de extensão de três minutos.

Os plasmídeos recombinantes (nomeados clone um, clone dois e clone três) foram purificados e um µg de DNA vindo de cada bacmídeo foi diluído em 200 µl de meio de cultura TC-100 (GIBCO), para cada amostra, cinco µl de lipofectina (Cellfectin, Invitrogen) foi adicionados em 200 µl de meio de cultura TC-100 (GIBCO). As duas misturas foram incubadas por 30 minutos a temperatura ambiente para que o DNA se incorporasse aos lipossomos. Após a incubação, o meio de cultura de três placas de 33 mm contendo monocamada de células de inseto da linhagem BTI-Tn5B1-4 (Granados et al., 1994) foi removido e um ml de mistura contendo DNA/lipofectina foi adicionada à placa, de modo a recobrir toda a camada celular. Este sistema foi incubado a temperatura ambiente por três horas e depois foram adicionados 1,5 ml de meio de cultura com 10% de soro fetal bovino (GIBCO). As células foram incubadas por sete dias a temperatura ambiente e observadas via microscopia de luz invertida após esse período (Axiovert 100, Zeiss).

Figura 17: Esquema representativo do sistema Bac-to-bac (Invitrogen). Dia 1: recombinação do gene de interesse no plasmídeo doador (pFastBac1), transformação em célula competente DH10Bac para transposição e geração do bacmídeo (baculovírus recombinante) (Dias 2-3); Dia 4: bacmídeo recombinante confirmado por meio de PCR usando primers M13pUC e os primers do gene de interesse; Dias 5-7: infecção celular usando bacmideo recombinante, titulação viral para determinar a infecção viral em novas células para obter proteína de interesse expressa (adaptado de Bac-to-bac Baculovirus Expression System Manual – Invitrogen).

4.3.3 Confirmação da expressão

Para confirmar se houve expressão da proteína do capsídeo foi realizada a purificação utilizando cloreto de césio de acordo com (Ausar et al., 2006). As células foram centrifugadas a 500 g por cinco minutos a temperatura ambiente. A concentração da VLP presente na fração do sobrenadante foi realizada por meio de colchão de sacarose a 20% e ultracentrifugação por duas horas (rotor SW70 Beckman) a 112400 g a 4°C. O sedimento foi então ressuspendido em PBS 0,5X, pH 5,5 e sedimentado através do CsCl (0,39 g/ml) (rotor SW28 Ti Beckman) a 104000 g por 18h a 4°C. Todas as fases foram coletadas e dialisadas em solução PBS 0,5, pH 5,5, por três horas. As amostras foram então coletadas e estocadas a 4°C até o uso. As células sedimentadas após a primeira centrifugação a 500 g por cinco minutos foram lisadas com tampão PBS 0,5X Triton 1%, seguida de uma centrifugação de 3800 g por 15 min. O

sobrenadante desse procedimento foi então processado como o sobrenadante incialmente separado das células.

Após a purificação uma eletroforese SDS-PAGE foi realizada para confirmar a expressão de CP, cuja banda esperada era de 60 kDa. Para a análise por meio de Western- blotting da expressão da CP em célula de inseto foi utilizado como anticorpo primário o anticorpo policlonal contra P2, cuja proteína foi expressa em E. coli.